Исключением является случай, если нужно погасить долг, взыскиваемый в суде. Такое разъяснение Минфина направляет ФНС. Отметим: инспекция принимает решение о зачете в течение 10 рабочих дней c момента, когда обнаружена переплата, или вступило в силу судебное решение, или подписан акт сверки.

Документ: Письмо ФНС России от 12.05.2015 № НД-4-8/7990@
Путеводитель по налогам: в каком порядке инспекция самостоятельно осуществляет зачет переплаты