Ответ:
Увольнение генерального директора организации на основании п. 3 ч. 1 ст. 77 ТК РФ не противоречит действующему законодательству.Правовое обоснование:
Руководителя (генерального директора) организации можно уволить по тем же основаниям, что и обычного работника (например, по собственному желанию), а также по основаниям, предусмотренным в ст. 278 ТК РФ специально для прекращения трудового договора с руководителем.
Увольнение по собственному желанию оформляйте как обычно - нужны заявление и приказ.
При этом формулировка увольнительной записи в графе 3 раздела "Сведения о работе" трудовой книжки будет такой же, как и при увольнении по собственному желанию других сотрудников: "Уволен по собственному желанию, пункт 3 части 1 статьи 77 Трудового кодекса Российской Федерации". То есть ссылаться на ст. 280 ТК РФ ("Досрочное расторжение трудового договора по инициативе руководителя организации") вместо ст. 77 ТК РФ, как это иногда бывает на практике, не нужно
Статья: Как директору ООО уволиться по собственному желанию (Мацепуро Н.А.) ("Главная книга", 2014, N 22) {КонсультантПлюс}
