Ответ:
Полагаем, что нет, факсимиле - штамп, точно воспроизводящий собственноручную подпись физического лица, - использовать на первичных документах нельзя, а транспортная накладная как раз относится к таковым.
Правовое обоснование:
Транспортная накладная - первичный документ установленной формы, который составляется при перевозке грузов автотранспортной компанией. На его основании заказчик транспортных услуг признает расходы на перевозку, а перевозчик - выручку.
Факсимиле - штамп, точно воспроизводящий собственноручную подпись физического лица, - использовать на первичных документах нельзя (Письмо Минфина от 13.04.2015 N 03-03-06/20808).
Таким образом, факсимильная, электронная копия либо иным образом воспроизведение подписи руководителя при поступлении документов, имеющих финансовые последствия, по мнению Минфина России, не являются оправдательными документами для целей учета по налогу на прибыль организаций. Аналогичная позиция отражена в постановлении Федерального арбитражного суда Поволжского округа от 20.06.2012 N А12-13422/2011.
Факсимильная, электронная копия либо воспроизведение подписи руководителя иным образом при поступлении документов, имеющих финансовые последствия, не являются оправдательными документами для целей учета по налогу на прибыль организаций (Письмо Минфина России от 13.04.2015 N 03-03-06/20808, Постановление ФАС ПО от 20.06.2012 N А12-13422/2011).