Ответ:
Если гражданско-правовой договор заключен менее чем через два года после увольнения работника, а также если он будет признан трудовым, у организации возникают последствия в части НДФЛ и страховых взносов.
Правовое обоснование:
Не признаются объектом налогообложения НПД, в частности, доходы от оказания (выполнения) физическими лицами услуг (работ) по гражданско-правовым договорам при условии, что заказчиками выступают работодатели указанных физических лиц или лица, бывшие их работодателями менее двух лет назад (п. 8 ч. 2 ст. 6 Закона N 422-ФЗ). Соответственно, доходы физического лица от оказания услуг или работ по гражданско-правовым договорам с его работодателем (бывшим его работодателем менее двух лет назад) не облагаются налогом в рамках НПД.
В связи с этим у организации возникают определенные риски в части налогообложения.
Если организация расторгнет трудовой договор с работником и в пределах двухлетнего срока заключит с ним гражданско-правовой договор как с самозанятым гражданином, то она признается налоговым агентом по НДФЛ (пп. 6 п. 1 ст. 208, п. 4 ст. 226 НК РФ).
Также организация является плательщиком страховых взносов с сумм соответствующих вознаграждений и будет обязана уплачивать их в общеустановленном порядке для выплат по гражданско-правовым договорам (п. 1 ст. 420 НК РФ).
При этом налоговый орган вправе изменять юридическую квалификацию характера отношений налогоплательщика с третьими лицами, однако это должно основываться на всестороннем исследовании фактических обстоятельств деятельности налогоплательщика, отражающих ее реальную сущность (Определение Конституционного Суда РФ от 26.10.2017 N 2470-О).
Взносы на травматизм подлежат уплате только в случае, если это предусмотрено гражданско-правовым договором (п. 1 ст. 20.1 Федерального закона от 24.07.1998 N 125-ФЗ "Об обязательном социальном страховании от несчастных случаев на производстве и профессиональных заболеваний" (далее - Закон N 125-ФЗ)).
Налоговые последствия при переквалификации гражданско-правового договора в трудовой
Доходы от трудовой деятельности не являются объектом налогообложения НПД (п. 1 ч. 2 ст. 6 Закона N 422-ФЗ).
Соответственно, в отношении доходов от такой деятельности организация должна исполнять обязанности налогового агента по НДФЛ, а также начислять и уплачивать страховые взносы.
В случае выявления у гражданско-правового договора с самозанятым гражданином признаков трудового организация может быть привлечена к ответственности в виде штрафа, организации могут быть начислены пени, а также выставлено требование об уплате задолженности (ст. ст. 69, 75, 122, 123, 226, п. 1 ст. 420 НК РФ).
Кроме того, если территориальный Фонд пенсионного и социального страхования РФ выявит у гражданско-правового договора признаки трудового, то организация может быть оштрафована, могут быть начислены пени, а также выставлено требование об уплате недоимки по страховым взносам на травматизм (ст. ст. 20.1, 26.6, 26.11, 26.29 Закона N 125-ФЗ).